1、行为人在主观目的上是不同的
根据我国《刑法》第二百四十二条规定，合同诈骗罪的构成关键是以非法占有为目的，在合同纠纷中，是没有这一要件的，合同诈骗的最后目的就是为了非法占有他人财产，占有后的财产转为他用或者自己挥霍，其根本没有履行合同的意思。合同纠纷中的当事人并不存在非法占有的目的，而是有履行合同的意愿，只是在履行合同义务的过程中，由于外在的因素致使合同无法正常履行，比如资金周转困难，购买的材料不能及时到位等等，客观上没有非法占有的故意。所以是否以非法占有为目的是二者在主观方面的主要区别。
2、两者客观构成不同
(1)合同诈骗罪在客观表现方面，是以隐瞒，虚构事实为要件，如冒用他人身份、伪造变造票据，开设空壳公司等等。在签订合同时，合同上所列的设备条件等，行为人是根本没有的，这些只是欺骗当事人的，为的是让对方在合同上签字。
(2)在合同纠纷中，行为人不必冒用他人的身份或条件来欺骗对方，可能为了获得更多的利益，行为人会夸大自己的能力或条件，虽然也有欺诈的行为，但较合同诈骗轻微的多。
3、行为人履行合同的态度不同
合同诈骗中，行为人没有履行合同的意愿，因为其根本不具备履行能力，只是单一的以非法占有为目的，一旦非法占有了他人财产，便会销声匿迹或者以任何理由推脱不履行合同，更不会归还财产或赔偿对方那个损失。合同纠纷当事人一般都会按照合同约定履行职责，并且具有一定的履行能力，履行诚意和积极性，一旦给对方造成损失，当事人会愿意承担责任并赔偿损失。
一、劳动合同诈骗罪的认定是怎样
（一）本罪与一般合同纠纷的界限合同纠纷与合同诈骗罪有许多相似之处：
第一，两者都产生于民事交往过程中，并且都以合同形式出现；
第二，在履行合同的过程中，对合同所规定的义务都不履行或不完全履行；
第三，合同诈骗在客观上表现为虚构事实或者隐瞒事实，合同纠纷中的当事人有时也伴有欺骗行为；
第四，两者都是非法占有特定物。行为人主观上有无非法占有他人财物的目的，是区别两者的关键。
行为人的主观目的可以从以下几个方面考察：
1、考察行为人在签订合同时有无履行合同的能力。
2、看行为人在签订和履行合同过程中有无欺骗行为。
3、看行为人在签订合同后有无履行合同的实际行动。
4、看行为人在违约以后是否愿意承担违约责任。
5、考察行为人未履行合同的原因。
（二）本罪与诈骗罪及其他诈骗犯罪的界限，区分合同诈骗罪与诈骗罪及其他诈骗犯罪的界限，关键在于诈骗行为是否是在合同签订、履行过程中产生的，则构成合同诈骗罪。
